Devenu chef de la Sûreté Parisienne, l'ancien bagnard François Vidocq s'est entouré d'anciens compagnons d'infortunes. Un de ses anciens compagnons de chaîne, Louis Desfossé, est compromis dans une affaire de meurtre et vient lui demander son aide : il est accusé d'avoir assassiné l'homme qui l'avait engagé. Après l'avoir aidé à s'échapper, Vidocq doit retrouver des lettres compromettantes pour la soeur de Napoléon, détenues par Fouché. Très vite, il apparaît que le "meurtre" de Desfossés et ces lettres sont liés : La victime, Rouvelart, détient les lettres et s'est fait passé pour mort pour ne pas le devenir, menacé qu'il est par le réseau auquel il appartient. C'est après avoir découvert l'imposture que ce réseau le capture et que Vidocq rencontre pour la première fois la baronne de Saint-Gely.

Le fait qu'un ancien bagnard soit devenu membre de la Police déplaît à une grande partie de cette administration. Alors, lorsque plusieurs courriers arrivent chez Mr Henry, dénonçant Vidocq comme maître chanteur, sa situation se complique particulièrement. Mais, cela n'est rien en comparaison du meurtre de l'un de ses accusateurs. En réaction, celui-ci enquête sur une mystérieuse organisation caritative qui chasse tous les mendiants qui viennent à ses portes : ses responsables sont Roxane de Saint-Gely et un certain François Vidocq... Pour les confondre, il se fait passer pour un riche trafiquant d'armes, qui ne tarde guère à être arrêté par des policiers véreux.

Joséphine de Beauharnais fait appel, en secret, à François Vidocq car son plus beau collier de diamants a été dérobé. Etonnamment, celle-ci a donné sa confiance à la baronne de Saint-Gely. Après une enquête rapide, Vidocq découvre qui est l'auteur du cambriolage : Mosco l'Alchimiste qui, à ses moments perdus, perce les coffres qu'on lui indique. L'ayant retrouvé, Vidocq est arrêté par de faux gendarmes qui l'amène en prison pour être exécuter à la place de l'Alchimiste. Se rappelant de son passé, il finit par s'évader déguisé en femme. Il ne lui reste plus qu'à découvrir le lieu où la Baronne a caché le collier. Mais, ce n'est pas si simple...

Avec le retour du Roi, c'est le service de la Sûreté qui est menacé. Pour éviter tout soucis, Mr Henry envoie Vidocq enquêter à Bargeville où l'on découvre après les combats entre Bonapartistes et Royalistes plus de morts qu'il n'en faudrait. Vidocq met à jour une vaste organisation qui tue et remplace les nobles émigrants pour les spolier de leur fortunes. En parallèle, la Baronne de Saint-Gely a fait installer à son domicile Flambart pour couvrir ses coupables activités. Très vite, Vidocq est amené à suspecter la Baronne...

A la suite de nombreuses attaques de brigands,le préfet de Région fait appel à titre officieux à Vidocq pour mettre fin aux vols. Il a notamment reçu une lettre alarmiste d'un maire qui appèle au secours. Vidocq se rend alors sur place sous les traits d'un bucolique membre de la Préfecture, plus intéressé par la chasse aux papillons que par les affaires policières. Malheureusement, les Chauffeurs ayant pris le contrôle du village, Vidocq doit redoubler de ruse pour les confondre. Il utilise alors un moyen infaillible pour y parvenir : semer la zizanie et attendre...

Le nouveau préfet de Police envoie Vidocq et Flambart à Toulon pour rétablir la sécurité dans la ville. En effet, en raison de la disette, les bagnards commencent à s'agiter : certains même disparaissent sans crier gare. Le chef de la Sûreté interroge un ancien compagnon de chaînes, Ploche, qui par peur des représailles ne lui dit rien. Pour gagner ses confidences, il le fait échapper et rend Flambart complice de cette évasion. Par reconnaissance, celui-ci lui avoue que les Banquiers du Crime sont derrière cette montée de violence. Se faisant alors passer pour l'un d'entre eux, il se rend à leur repère, où il est capturé. Il reçoit alors la visite de leur chef avant d'être exécuté...